二次抵押是指在一次抵押贷款的基础上再次进行抵押贷款的一种操作。在进行二次抵押时，房产证是一份非常重要的资料，它是贷款机构对抵押物所有权的有力证明。因此，被收走的情况在实际操作中是存在的。

首先，二次抵押一般需要贷款人将房产证提交给贷款机构进行查验与备案。这是为了确保该房产在进行二次抵押的过程中没有发生转让或变更所有权的行为。经过核实房产证的真实性和完整性后，贷款机构会将其放入保险柜或指定的安全仓库中予以保管。

其次，如果借款人未按照合同约定履行还款义务，拖欠还款时间超过一定期限，贷款机构可能采取收走房产证的措施。这是因为在二次抵押的过程中，贷款机构具有一定的抵押权。如果借款人无法按时偿还借款，违约行为会造成贷款机构经济损失，因此贷款机构有权采取措施保护自身权益，其中之一就是要求借款人归还房产证。

然而，要注意的是，贷款机构不会一味地要求收走房产证，而是会在多种方式之间进行权衡和考虑。在实际操作中，贷款机构可能优先考虑通过其他合法途径解决借款人的拖欠问题，例如与借款人协商制定还款计划、采取法律途径追偿等。只有在这些方式无效的情况下，贷款机构才会采取收走房产证的措施，以实现抵押物的转让和处置。

总之，在二次抵押的过程中，房产证是一份重要的资料，贷款机构有权要求借款人提交并保管房产证。如果借款人未能按时履行还款义务，贷款机构可能采取收走房产证的措施，以保护自身合法权益。然而，贷款机构在决策时会综合考虑多种因素，通过诉讼、协商等途径解决问题，只有在其他方式失效时才会采取措施收走房产证。因此，借款人应当充分了解贷款合同的约定，并按时履行还款义务，以避免面临不必要的风险和困扰。